我在網路上看到了一些資料以及詢問過來人的經驗,其實有點茫然,如何將數據從Excel表格匯入到SPSS再匯入到其他軟體內進行資料分析?
我整理一些Data science的文章,會一步一步的累積資料,今天是day 0。
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🧬 Bioinformatics 必備工具與軟體(根據社群討論)
以下是 Reddit 使用者在討論「不可或缺的 bioinformatics 工具」時常提到的項目:
🔧 常用程式語言與環境
- Python:廣泛應用於資料處理、機器學習與 pipeline 建構(常用套件如 Biopython、Pandas、Scikit-learn)
- R:統計分析與視覺化首選(常用套件如 DESeq2、ggplot2、edgeR)
- Bash/Shell scripting:用於自動化分析流程與處理大型資料集
- Jupyter Notebook / RStudio:互動式分析與報告撰寫工具
🧪 常見分析工具與平台
| 類型 | 工具 | 功能 |
|---|---|---|
| 序列比對 | BLAST, Bowtie2, BWA | 基因序列比對與比對速度優化 |
| 基因體組裝 | SPAdes, Velvet | de novo 組裝與品質評估 |
| RNA-Seq 分析 | STAR, HISAT2, DESeq2 | 表現量分析與差異基因篩選 |
| 結構分析 | GROMACS, PyMOL | 蛋白質結構模擬與視覺化 |
| 資料庫 | Ensembl, NCBI, UCSC Genome Browser | 基因註解與資料查詢 |
🧠 如何準備 bioinformatics 職位
📚 技能與知識面
- 統計與數據分析能力:熟悉假設檢定、回歸分析、多變量分析
- 程式能力:Python 與 R 是基本配備,Git 版本控制也很重要
- 生物學背景:理解基因表現、轉錄、蛋白質功能等核心概念
- 資料庫與工具熟悉度:能快速查詢並應用公共資料庫與工具
🧰 實務經驗與作品集
- 建議建立 GitHub 專案,展示處理真實資料的能力(如 RNA-Seq pipeline、GWAS 分析)
- 撰寫技術部落格或筆記,分享分析流程與學習心得
- 參與開源專案或 Kaggle 生物資料競賽,累積實戰經驗
💬 面試準備建議
- 熟悉你使用過的工具與分析流程,能清楚解釋每一步的目的與選擇理由
- 準備好討論你如何處理錯誤、資料清理、結果驗證等細節
- 展現跨領域溝通能力,能與生物學家或臨床人員有效合作
題外話
我是想做動物科學畜牧領域牧場的部分,希望可以透過畜牧場的資料匯入SPSS、Excel然後再透過Machine learning的方式,首先將資料分類後進行分析。


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